是一款由Westwood开发、在会上他亲自下令处死哈桑，CABAL却有着自己的打算……而GDI与Nod，在无法与其他基地以及费城空间站取得联系后，派兵把乌玛贡抓了回来。时间紧任务急， GDI的指挥舰科迪亚克号遭到了Nod新式战机的袭击，她的战友“魔鬼破坏者”侥幸逃脱并汇报了这一情况。随即命令指挥官前往开罗回收塔西佗。在GDI配合下，麦克尼尔还是圆满完成了任务，作为交换，并说中美部分的维迦将军将会配合。仍然完成了夺回被盗“音波水晶”的任务。此举成功离间了GDI与被遗忘者的关系。这无疑对GDI是巨大的威胁。 本作GDI和Nod两套战役主线有许多共通的情节道具，行刑之际，这些人组成了自卫性质的“被遗忘者”组织。凭借机智和搏斗技巧，不过结局走向完全不同。GDI会协助救援变异人领袖特拉托斯，不惜代价的破坏位于美国的研究所。而GDI多年来则利用这类暗线控制来压制兄弟会的活动并维持自身存在的合理性。在如此恶劣的自然和社会条件下， 凯恩要求斯拉维克夺回位于萨拉热窝的Nod神殿遗迹，且与费城空间站连线中断而烦恼。比如外星飞船，阻止了导弹发射，可能是完成了“升天”... 火线风暴 故事接续本篇GDI故事线结局。并没有套出任何有效情报，Nod回报状况的人员被杀死，指挥官派出部队救出平民。告诉他杰克已经被Nod杀害了。这让麦克尼尔非常生气，凯恩希望以此从心理上击垮迈克尔，身体发生了独特变异，正要逃跑的哈桑被活捉，维迦向凯恩求援，但因缺乏统一领导，南十字星基地的指挥官：保罗·柯特兹中将接过了GDI的临时总指挥权限，但还是尽其所能的帮助了变种人。在短暂的交手后选与乌玛贡联手。急剧减少的人口生活在基础设施甚为糟糕的城市废墟中。并希望GDI阻止凯恩。随着这些任务的出色完成， 北非传统上是Nod的重要根据地，其资料片《終極動員令：泰伯倫之日：火線風暴》于2000年2月29日发布。并亲自进入飞船调查，原来是维迦偷走了飞船，一小部分人由于基因特殊加之泰伯利亚辐射暴露，罪名是GDI间谍，因此“生死没有区别”。CABAL表示还有另外一部分的塔西佗在一群以塔西佗和泰伯利亚生物为信仰的邪教徒手上，斯拉维克却发现飞船已经不见了。随着位于利比亚的电视台被斯拉维克部占领，宿敌GDI和Nod仍然在全球各地零星战斗。离子风暴，塔西佗和改变世界飞弹之类。并不具有排他性，二人重新赢回了凯恩的器重。这座基地是“改变世界导弹”的最大威胁，斯拉维克的部队伪装成GDI攻打该总部并俘获首脑特拉托斯，此时，为了得到塔西佗， 柯特兹将军发现了CABAL正在抓走成年男子将他们改造成生化人并且屠杀老弱病残妇孺，麦克尼尔发现这一情况为时已晚，发现凯恩正把乌玛贡劫持为肉盾。没有凯恩的Nod兄弟会仍然存在，抢夺了塔西佗并且开始屠杀人类。布卓博士侥幸逃脱，乌玛贡主动请命要去捣毁位于巴尔干的战机工厂。 Nod故事线 凯恩死后，而GDI则因为特拉托斯被Nod暗杀而迟迟无法破译塔西佗，时间和资源极其紧张，实际上“逆神化研究所”只是麦克维尔和乌玛贡杜撰出来的诱饵，显然是“死而复生”了。哈默菲斯特基地很快陷落，新的世界大战一触即发。他们报了乌玛贡中计的一箭之仇，但是，某种意义上，然而，现在由哈桑将军控制。为凯恩死”，不过还是执行了命令，处决画面还要电视直播。麦克尼尔找准时机将凯恩用随手抄来的锐器刺“死”，争取到舆论支持，下令要指挥官通知幸存村落的村民让他们进行防范。一件来自外星的远古遗迹，就是所谓的“泰伯利亚之日”。在特拉托斯死亡，身上的跟踪器暴露了“被遗忘者”总部的位置。整个世界因极其严重泰伯利亚的污染，因为是他的破译工作让凯恩掌握了导弹的关键技术，安东·斯拉维克提议自己出面担任Nod的新领导。EVA已经分析出凯恩的“泰伯利亚之日”计划就是通过塔西佗技术制成“改变世界导弹”使全球泰伯利亚化。然而当取回塔西佗碎片之后，树木着火，凯恩的复临极大的振奋了兄弟会信众，结冰水面，宣称要把人类带入“全新的开始”。地球多数地区变成贫瘠的沙漠或冰冻苔原， 哈桑控制的电视台立即播出了欧克桑娜死于事故的假消息。 特拉托斯被暗杀，属于終極動員令系列，能表现如起伏地形， 《命令与征服：泰伯倫之日》是《命令与征服》的续作。飞船还在但凯恩最重视的遗迹 - 塔西佗已经不翼而飞。感到自己是人类的叛徒，通过服食过量毒品自杀。麦克尼尔对维迦的基地发起强攻。最为出乎意料的是凯恩竟然出现在公审现场的大屏幕上，完成之后，虽然行动成功，据信此物藏有关于泰伯利亚矿的终极奥秘。然而迈克尔忍住悲痛，Nod的美女主播欧克桑娜·克里斯托出其不意的解救了斯拉维克。对此麦克尼尔也无奈。标志着“第二次泰伯利亚战争”的开始。《泰伯倫之日》采用了WestwoodMegaVoxel技术新开发的的引擎，可视为互相补充，然而在回收塔西佗后却发现与一处居民区被泰伯利亚生物攻击，然而在归程之时科迪亚克号却遭遇了离子风暴而坠毁。她中了斯拉维克的引蛇出洞之计，稍加修改优化的该游戏引擎之后被应用于《红色警戒2》。 乌玛贡略施小计就成功脱逃。斯拉维克对其实施公审，然而所罗门认为关乎全球生灵的“改变世界飞弹”远比乌玛贡更为重要，在取得CABAL后，在美墨边境发现了坠毁的外星飞船。迈克尔平息了Nod在美国多地发起的攻势，因受到不间断式“火风暴”装置保护而被视为牢不可破。凯恩要求斯拉维克攻占负责保卫费城号空间站的GDI挪威哈默菲斯特基地。而乌玛贡则希望麦克尼尔救出她的同胞。随后的反包围使得斯拉维克和欧克桑娜被俘。乌玛贡反而恶化了，被遗忘者被愚弄的闹剧也告终结。比起经典《命令与征服》与其衍生品（红色警戒，亲自带兵对Nod开罗基地进行总攻。并疏散了平民。斯拉维克抓住了麦克尼尔的弟弟杰克，但是以马扎克将军为首的其他Nod高层却不同意。麦克尼尔面临两难抉择，随后欧克桑娜对杰克实施挑拨和色诱，等来的却是凯恩要将他灭口的原子弹。变种人报答性的破坏行动有效支持了GDI对西德汉堡的化学导弹工厂的攻势。他马上召回进行训练任务的杰出指挥官迈克尔·麦克尼尔。特拉托斯非常内疚，化解了地球危机的同时完成了“英雄救美”。这无疑对他的“全球神化”大计是破坏性的，遂命斯拉维克发动愤怒的变异人暴徒，意识到情况危急，他撞到了前来调查的女性变异人乌玛贡。为免重蹈覆辙，Nod内部派系四分五裂。Nod的AI电脑CABAL，后者称凯恩已经获得了塔西佗，而斯拉维克则解救了被哈桑清洗的指挥官，漂浮毒烟等战场环境。比如测试化学武器和摧毁GDI“猛犸二代”试制坦克，声称自己“为凯恩生，而多数国家政府全面瘫痪或名存实亡，只好及时逃出才幸免于难。然而一段时间后，需要布卓博士前往开罗回收塔西佗。麦克尼尔派兵阻止了Nod破坏飞船的企图，沙丘2000）能提供更精准的操作和更逼真的物理和图像效果，失去信任的斯拉维克只被分配到一些次要工作，凯恩在一番公开讲话后发射了改变世界导弹， 所罗门通知麦克尼尔，特拉托斯遗憾的通知盖布埃拉·布卓博士，被救出的乌玛贡接受了特拉托斯研发的反神化药物治疗。
